浙江大学流体工程研究所的前身是流体力学教研室。研究所现有流体力学和流体机械及工程两个博士点和硕士点，其中流体力学是浙江省重点学科，流体机械及工程是动力工程与工程热物理国家重点学科的二级学科;同时研究所还是流体动力与机电系统国家重点实验室的组成部分。流体力学学科现有博士生导师10人，硕士生导师14人。学科带头人林建忠教授为国家***基金获得者，入选“全国***万人才工程”第一、二层次、浙江省特级专家和教育部“跨世纪优秀人才”计划。
研究所主要研究方向有多相流、湍流理论及其应用、叶轮机械流体力学、计算流体力学等。近年来承担包括国家自然科学基金重点项目、国家***基金、国家自然科学基金面上项目在内的各种纵向科研项目30余项，横向合作项目100余项。获国家级奖励4项、省部级奖励近20项。沈天耀教授团队的研究成果获国家科技进步一等奖、国家科技进步三等奖、国家发明三等奖各1项，其中作为第一完成单位获得的国家科技进步一等奖填补了浙江大学空白。林建忠教授团队的研究成果于2006年、2009年分别两次获得浙江省科技进步一等奖。沈新荣教授团队2013年获国家科技进步一等奖1项。
